ReaxFF

med den specialiserade atomistiska potentialen i reactive force field (ReaxFF) kan du modellera storskaliga system där kemiska reaktioner förekommer. I samarbete med van Duin-gruppen har SCM parallelliserat och optimerat den ursprungliga ReaxFF-koden avsevärt. Reaktioner i komplexa kemiska blandningar på totalt hundratusentals atomer kan nu modelleras på en modern stationär dator.

medan traditionella, harmoniska kraftfält inte kan hantera bindningsbrott och bindningsbildning, var ReaxFF utformad för att hantera kemiskt dynamiska system. Det kan också hantera element som är notoriskt svåra för klassiskt kraftfält, såsom övergångsmetaller. Vi inkluderar över 80 reaxff kraftfält filer för många olika kombinationer av element.

prova själv!

studera komplexa system med reaktiv molekyldynamik

reaxff-modulen i Amsterdam Modeling Suite innehåller också många avancerade alternativ, inklusive (re)parametriseringsverktyg för att förfina kraftfält eller bygga nya reaxff-parameteruppsättningar. ReaxFF har använts under det senaste decenniet i olika studier av komplicerade reaktiva system, inklusive förbränningskemi, polymerer, nanopartiklar, biologiska system, ytkemi och batterier.

utvalda Reaxff-videodemonstrationer

mekaniska egenskaper hos epoxidpolymerer
SCM: s expert Ole Carstensen visar hur man kan förutsäga de mekaniska egenskaperna hos härdpolymerer från atomistiska modeller.

montering ReaxFF kraftfält parametrar med CMA-ES
SCM expert Tomas Trnka delar några tips & tricks för reaxff parameter montering med Amsterdam Modeling Suite.

Grafiskt Användargränssnitt: förberedelse, utförande & analys

sömlös integration med det grafiska användargränssnittet AMS2020

  • lätt att installera komplexa system med Packmol builder
  • definiera temperatur, volym och elektriska fältregimer
  • olika termostater och barostater
  • tryck-och bindningsbegränsningar
  • lokal och fjärrkörning, jobbövervakning
  • analysera förändrade molekylära sammansättning och reaktionsvägar (ChemTraYzer), spåra ytreaktioner
  • visualisera lokal stress, lokal t
  • amstrain: Skapa och hantera träningssatser för reaxff re-parametrization

reaxff Fitting tutorial

kolla in vår avancerade handledning om hur du passar reaxff force field-parametrar med de senaste parametriseringsverktygen: AMStrain och CMA-ES.

accelererande molekyldynamik: långa tidsskalor och metadynamik

  • accelerera bindningsbrytning med kollektiv Variabeldriven Hyperdynamik
  • molekylpistol och molekylsänka: deponering av atomer och molekyler, CVD, sputteringsprocesser
  • bond boost för tvärbindande polymerer
  • Grand-Canonical Monte Carlo: reaktivitet under termodynamiska jämviktsförhållanden
  • force-bias Monte Carlo
  • olika fria energimetoder och MD-analys via PLUMED-biblioteket

andra ReaxFF-funktioner

  • hybrid parallellisering (MPI, openMP)
  • stöder molekylär (0D), 1D, 2D och 3D periodiska system
  • geometrioptimering, icke-reaktiv eller reaktiv molekyldynamik
  • innehåller alla de senaste reaxff-KRAFTFÄLTEN
  • värmeledningsförmåga (t-nemd)
  • väl parallelliserad och linjär skalning: benchmark indatafiler för ReaxFF (baserat på LAMMPS PETN benchmark)
  • ACKS2 laddningsjämvikt: korrekt långdistansladdningsbeteende( batterier, enzymer)
  • eReaxFF: explicita elektroner

”reaxff reactive force field: utveckling, tillämpningar och framtida riktningar” är en utmärkt introduktion till reaktiv molekyldynamik.

Hands-on workshops

tidigare har vi gett några specialiserade reaxff workshops om parametrering och acceleration. Om du är intresserad av att vara värd eller delta i framtida ämnesspecifika workshops, vänligen meddela oss.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.