Original Investigationen ny metod för att identifiera den hotade Pyreneiska desmanen (Galemys pyrenaicus) och att studera dess diet med hjälp av nästa generations sekvensering från avföring

den Pyreneiska desmanen (Galemys pyrenaicus) är ett litet utrotningshotat halvvattenlevande däggdjur som är endemiskt för pyreneiska berg och till den norra halvan av den Iberiska halvön vars ekologi och biologi fortfarande är dåligt kända. Syftet med denna studie var att identifiera Pyrenean desman avföring och att analysera dess diet från detta material med hjälp av nästa generations sekvenseringsmetoder. Vi förstärkte och sekvenserade en liten DNA-minibarkod (133 bp) av COI-genen i tjugofyra förmodade fecesprover av Pyrenean desman och identifierade framgångsrikt arten i 16 prover. Andra identifierade arter var däggdjur, fåglar och amfibier, vilket bevisar den potentiella tillämpningen av våra metoder på en större panel av taxa.

i Pyrenean desman feces kunde vi identifiera nitton bytesarter med en positiv matchning (mer än 98% av identiteten med en referenssekvens) och elva förmodade bytesarter med lägre identitetspoäng (90-96%). De nitton arterna tillhörde fyra order och elva familjer, bland vilka Trichoptera och Hydropsychidae var de vanligaste. Framtida förbättringar kan erhållas genom att utvidga referens-DNA-sekvenssamlingen för att nå exakta identifieringar över Desmans sortiment och genom att öka provtagningen för att få bättre kunskap om den lokala kosten hos denna hotade Art. Sådan information är av stor betydelse för att föreslå de bästa förvaltningsåtgärderna för bevarande.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.