ReaxFF

Com a especializada atomizado potencial reativo de campo de força (ReaxFF), você pode modelar sistemas de larga escala, onde as reações químicas estão ocorrendo. Em colaboração com o grupo van Duin, o SCM paralelizou e otimizou significativamente o código ReaxFF original. Reações em misturas químicas complexas, totalizando centenas de milhares de átomos, agora podem ser modeladas em um computador desktop moderno.

embora os campos de força harmônicos tradicionais não possam lidar com a quebra de ligações e a formação de ligações, o ReaxFF foi projetado para lidar com sistemas quimicamente dinâmicos. Também pode lidar com elementos que são notoriamente difíceis para o campo de força clássico, como metais de transição. Incluímos mais de 80 arquivos de campo de força ReaxFF para muitas combinações diferentes de elementos.

tente por si mesmo!

estude sistemas complexos com dinâmica molecular reativa

o módulo ReaxFF no Amsterdam Modeling Suite também inclui muitas opções avançadas, incluindo (re)ferramentas de parametrização para refinar campos de força ou construir novos conjuntos de parâmetros ReaxFF. ReaxFF tem sido usado na última década em vários estudos de sistemas reativos complicados, incluindo química de combustão, polímeros, nanopartículas, sistemas biológicos, química de superfície e baterias.

demonstrações de vídeo Reaxff selecionadas

propriedades mecânicas de polímeros de epóxido
o especialista da SCM, Ole Carstensen, demonstra como prever as propriedades mecânicas de polímeros termofixos de modelos atomísticos.

ajustar os parâmetros do campo de força ReaxFF com CMA-ES
o especialista da SCM, Tomas Trnka, compartilha algumas dicas & truques para o ajuste do parâmetro ReaxFF com o Amsterdam Modeling Suite.

Interface Gráfica Do Usuário: preparação, execução & análise

integração com o AMS2020 interface gráfica do usuário

  • Fácil de configurar sistemas complexos com Packmol builder
  • Definir a temperatura, o volume e o campo elétrico regimes
  • Vários termostatos e barostats
  • Pressão e bond restrições
  • Local e remoto de execução, o monitoramento do trabalho
  • Análise de mudança de composição molecular e reação vias (ChemTraYzer), faixa de reações de superfície
  • Visualizar locais de estresse, local T
  • AMStrain: Criar e gerenciar conjuntos de treinamento para ReaxFF re-parametrização

ReaxFF Montagem tutorial

confira o nosso tutorial avançado de como ajuste ReaxFF força parâmetros de campo com as mais recentes ferramentas de parametrização: AMStrain e CMA-ES.

acelerando a dinâmica molecular: longas escalas de tempo e metadinâmica

  • acelere a quebra de ligações com hiperdinâmica coletiva acionada por variáveis
  • injetor de moléculas e dissipador de moléculas: depósito de átomos e moléculas, DCV,processos de pulverização catódica
  • impulso de ligação para polímeros reticulados
  • Grand-Canonical Monte Carlo: reactividade sob condições de equilíbrio termodinâmico
  • força-viés de Monte Carlo
  • vários métodos de energia livre e MD análise através de PLUMED biblioteca

Outros ReaxFF recursos

  • híbrido de paralelização (MPI, openMP)
  • suporta molecular (0D), 1D, 2D e 3D, sistemas periódicos
  • de otimização de geometria, não-reativo ou reativa, dinâmica molecular
  • inclui todas as últimas ReaxFF campos de força
  • condutividade térmica (T-NEMD)
  • bem paralelizados e lineares-escalonamento: referência arquivos de entrada para o ReaxFF (com base no LAMMPS PETN benchmark)
  • ACKS2 de carga de equilíbrio: corrigir longo intervalo de carga de comportamento (baterias, enzimas)
  • eReaxFF: explícita elétrons

“O ReaxFF reativa campo de força: desenvolvimento, aplicações e orientações futuras” é uma excelente introdução ao reativo de dinâmica molecular.

oficinas práticas

no passado, demos algumas oficinas especializadas de ReaxFF sobre parametrização e aceleração. Se você estiver interessado em hospedar ou participar de futuros workshops específicos de tópicos, informe-nos.

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