ReaxFF

dzięki wyspecjalizowanemu potencjałowi atomistycznemu w polu sił reaktywnych (ReaxFF) możesz modelować układy na dużą skalę, w których zachodzą reakcje chemiczne. We współpracy z grupą van Duin SCM dokonał równoległej i znaczącej optymalizacji oryginalnego kodu ReaxFF. Reakcje w złożonych mieszaninach chemicznych o łącznej liczbie setek tysięcy atomów można teraz modelować na nowoczesnym komputerze stacjonarnym.

podczas gdy tradycyjne, harmoniczne pola siłowe nie radzą sobie z łamaniem wiązania i tworzeniem wiązania, ReaxFF został zaprojektowany do radzenia sobie z chemicznie dynamicznymi układami. Może również radzić sobie z elementami, które są notorycznie trudne dla klasycznego pola siłowego, takimi jak metale przejściowe. Mamy ponad 80 plików pola ReaxFF dla wielu różnych kombinacji elementów.

spróbuj sam!

badanie złożonych systemów z reaktywną dynamiką molekularną

moduł ReaxFF w Amsterdam Modeling Suite zawiera również wiele zaawansowanych opcji, w tym narzędzia (re)parametryzacji do udoskonalania pól siłowych lub budowania nowych zestawów parametrów ReaxFF. ReaxFF był używany w ciągu ostatniej dekady w różnych badaniach skomplikowanych systemów reaktywnych, w tym chemii spalania, polimerów, nanocząstek, systemów biologicznych, chemii powierzchni i baterii.

wybrane prezentacje wideo ReaxFF

właściwości mechaniczne polimerów epoksydowych
ekspert SCM Ole Carstensen pokazuje, jak przewidywać właściwości mechaniczne polimerów termoutwardzalnych z modeli atomistycznych.

dopasowanie parametrów pola siłowego ReaxFF za pomocą CMA-ES
ekspert SCM Tomas Trnka dzieli się kilkoma wskazówkami & triki dotyczące dopasowania parametrów ReaxFF w Amsterdam Modeling Suite.

Graficzny Interfejs Użytkownika: przygotowanie, wykonanie & analiza

Bezproblemowa integracja z GRAFICZNYM interfejsem użytkownika AMS2020

  • łatwe konfigurowanie złożonych systemów za pomocą packmol builder
  • Definiowanie reżimów temperatury, objętości i pola elektrycznego
  • różne termostaty i barostaty
  • ograniczenia ciśnienia i wiązania
  • wykonanie lokalne i zdalne, monitorowanie zadań
  • Analizowanie zmieniającego się składu molekularnego i ścieżek reakcji (ChemTraYzer), śledzenie reakcji powierzchniowych
  • wizualizuj lokalny stres, lokalny t
  • amstrain: Tworzenie i Zarządzanie zestawami treningowymi dla reaxff re-parametryzacja

Reaxff Fitting tutorial

sprawdź nasz zaawansowany tutorial jak dopasować parametry pola siłowego ReaxFF za pomocą najnowszych narzędzi parametryzacyjnych: AMStrain i CMA-ES.

przyspieszenie dynamiki molekularnej: Długie ramy czasowe i metadynamika

  • Przyspiesz zerwanie wiązania dzięki kolektywnej Hiperdynamice o zmiennym napędzie
  • Pistolet cząsteczkowy i zlew cząsteczkowy: odkładanie atomów i cząsteczek, CVD, procesy rozpylania
  • wzmocnienie wiązania dla polimerów sieciujących
  • Grand-Canonical Monte Carlo: reaktywność w warunkach równowagi termodynamicznej
  • force-bias Monte Carlo
  • różne metody wolnej energii i analiza MD za pośrednictwem biblioteki PLUMED

inne funkcje ReaxFF

  • równoległość hybrydowa (MPI, openMP)
  • obsługuje molekularne (0D), 1D, 2D i systemy okresowe 3D
  • optymalizacja geometrii, niereaktywna lub reaktywna dynamika molekularna
  • obejmuje wszystkie najnowsze pola siłowe reaxff
  • przewodność cieplna (t-nemd)
  • dobrze równoległe i liniowe skalowanie: pliki wejściowe benchmarku dla ReaxFF (oparte na benchmarku LAMMPS PETN)
  • acks2 równoważenie ładunku: prawidłowe zachowanie ładunku dalekiego zasięgu (baterie, enzymy)
  • eReaxFF: wyraźne elektrony

„reaxff reactive force field: development, applications and future directions” to doskonałe wprowadzenie do reaktywnej dynamiki molekularnej.

warsztaty praktyczne

w przeszłości przeprowadziliśmy kilka specjalistycznych warsztatów ReaxFF dotyczących parametryzacji i akceleracji. Jeśli jesteś zainteresowany prowadzeniem lub uczestnictwem w przyszłych warsztatach tematycznych, daj nam znać.

Dodaj komentarz

Twój adres e-mail nie zostanie opublikowany.