ReaxFF

med det spesialiserte atomistiske potensialet i reaktivt kraftfelt (ReaxFF) kan du modellere store systemer der kjemiske reaksjoner forekommer. I samarbeid med van duin-gruppen har SCM parallellisert Og betydelig optimalisert den opprinnelige reaxff-koden. Reaksjoner i komplekse kjemiske blandinger på totalt hundretusener av atomer kan nå modelleres på en moderne stasjonær datamaskin.

mens tradisjonelle, harmoniske kraftfelt ikke kan håndtere bindingsbryting og bindingsdannelse, Ble ReaxFF designet for å håndtere kjemisk dynamiske systemer. Det kan også håndtere elementer som er notorisk vanskelig for klassisk kraftfelt, for eksempel overgangsmetaller. Vi har over 80 ReaxFF kraftfelt filer for mange forskjellige kombinasjoner av elementer.

Prøv selv!

Studie komplekse systemer med reaktiv molekylær dynamikk

reaxff-modulen i Amsterdam Modeling Suite inneholder også mange avanserte alternativer, inkludert (re)parametriseringsverktøy for å forfine kraftfelt eller bygge nye reaxff-parametersett. ReaxFF har blitt brukt det siste tiåret i ulike studier av kompliserte reaktive systemer, inkludert forbrenningskjemi, polymerer, nanopartikler, biologiske systemer, overflatekjemi og batterier.

Utvalgte ReaxFF Videodemonstrasjoner

Mekaniske egenskaper av epoksydpolymerer
Scms ekspert Ole Carstensen demonstrerer hvordan man kan forutsi de mekaniske egenskapene til termosettpolymerer fra atomistiske modeller.

Montering Av reaxff kraftfeltparametere MED Cma-ES
SCMS ekspert Tomas Trnka deler noen tips & triks for reaxff-parametermontering med Amsterdam Modeling Suite.

Grafisk Brukergrensesnitt: forberedelse ,utførelse& analyse

Sømløs integrasjon MED ams2020 grafisk brukergrensesnitt

  • lett å sette opp komplekse systemer med Packmol builder
  • Definer temperatur, volum og elektriske feltregimer
  • Ulike termostater og barostater
  • Trykk-og bindingsbegrensninger
  • lokal og ekstern utførelse, jobbovervåking
  • Analyser skiftende molekylære sammensetning og reaksjonsveier (ChemTraYzer), spor overflatereaksjoner
  • visualiser lokalt stress, lokalt t
  • amstrain: Opprett og administrer treningssett for ReaxFF re-parametrization

Reaxff Fitting tutorial

Sjekk ut vår avanserte opplæring om hvordan du passer ReaxFF force field parametere med de nyeste parametrization verktøy: AMStrain og CMA-ES.

Akselererende molekylær dynamikk: Lange tidsskalaer og metadynamikk

  • akselerere bond bryte Med Kollektive Variabel-drevet Hyperdynamikk
  • molekyl pistol og molekyl vask: deponering av atomer og molekyler, CVD, sputtering prosesser
  • bond boost for tverrbindende polymerer
  • Grand-Canonical Monte Carlo: Reaktivitet under termodynamiske likevekt forhold
  • force-bias Monte Carlo
  • ulike fri energi metoder og MD analyse via PLUMED biblioteket

Andre ReaxFF funksjoner

  • hybrid parallellisering (MPI, openMP)
  • støtter molekylær (0D), 1D, 2D og 3d periodiske systemer
  • geometrioptimalisering, ikke-reaktiv eller Reaktiv molekylær dynamikk
  • inkluderer alle DE NYESTE reaxff KRAFTFELTENE
  • termisk ledningsevne (t-nemd)
  • brønnparallelisert og lineær skalering: referanseinndatafiler For ReaxFF (basert På LAMMPS PETN-benchmark)
  • ACKS2 ladetilpasning: korrekt langtrekkende ladeoppførsel (batterier, enzymer)
  • ereaxff: eksplisitte elektroner

«ReaxFF reactive force field: development, applications and future directions» er en utmerket introduksjon til reaktiv molekylær dynamikk.

Praktiske workshops

tidligere har vi gitt noen spesialiserte reaxff-workshops om parameterisering og akselerasjon. Hvis du er interessert i å være vert for eller delta i fremtidige emnespesifikke workshops, vennligst gi oss beskjed.

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.