Anerkjennelsessekvens

en anerkjennelsessekvens er EN DNA-sekvens som et strukturelt motiv av ET DNA-bindende domene viser bindende spesifisitet til. Gjenkjenningssekvenser er palindromer.

transkripsjonsfaktoren Sp1 binder for eksempel sekvensene 5′-(G/T)GGGCGG (G/A)(G/A) (C/T) -3′, hvor (G/T) indikerer at domenet vil binde en guanin eller tymin i denne posisjonen.

restriksjonsendonuklease PstI gjenkjenner, binder og klipper sekvensen 5′-CTGCAG-3′.

en gjenkjenningssekvens er forskjellig fra et gjenkjenningssted. En gitt gjenkjenningssekvens kan forekomme en eller flere ganger, eller ikke i det hele tatt, på et bestemt DNA-fragment. Et anerkjennelsessted er spesifisert av plasseringen av nettstedet. For eksempel er det to psti-gjenkjenningssteder i FØLGENDE DNA-sekvensfragment, som starter ved henholdsvis base 9 og 31. En gjenkjenningssekvens er en spesifikk sekvens, vanligvis svært kort (mindre enn 10 baser). AVHENGIG av graden av spesifisitet av proteinet, KAN ET DNA-bindende protein binde seg til mer enn en bestemt sekvens. For PstI, som har en enkelt sekvens spesifisitet, er det 5 ‘- CTGCAG-3′. Det er alltid det samme om det første gjenkjenningsstedet eller det andre i følgende eksempelsekvens. For Sp1, som har flere (16) sekvensspesifikasjoner som vist ovenfor, er de to gjenkjenningsstedene i følgende eksempelsekvensfragment på 18 og 32, og deres respektive gjenkjenningssekvenser er 5′-GGGGCGGAGC-3′ og 5′-TGGGCGGAAC-3’.

5′ – AACGTTAGCTGCAGTCGGGGGGAGCTAGGCAGGAATTGGGCGGAACCT-3 ‘

Legg igjen en kommentar

Din e-postadresse vil ikke bli publisert.