Mød Ankit Patel, Kvantitigene-Assayudvikler hos Thermo Fisher Scientific

Plus: 6 tip til Kvantitigenassays

når du vil have et assay, der kan detektere nukleinsyrer, vil du sandsynligvis vælge Invitrogen-Procartapleks af høj kvalitet og Kvantitigenpleks-assays fra Thermo Fisher Scientific, en Lumineks-partner. Kvantificeringsanalysen bruger Forgrenet DNA (bDNA) teknologi, der er afhængig af signalforstærkning i stedet for målforstærkning for optimal kvantificering af udskrifter. En af forskerne bag design og udvikling af Kvantitigenanalysen er Ankit Patel, en videnskabsmand inden for bioinformatiktjenester hos Thermo Fisher. Vi indhentede ham for at lære mere om hans arbejde og de analyser, han udvikler.

spørgsmål: Hvad laver du hos Thermo Fisher?

Ankit Patel: Jeg vil beskrive min primære rolle som bioinformatiktjenester, hvor vi arbejder direkte med distributører, salg, marketing og/eller kunder for at hjælpe med at designe nye analyser. Kunder vil henvende sig til os med deres projekter, og vi arbejder sammen med dem for at udvikle det bedst mulige assay for at besvare deres eksperimentelle spørgsmål, herunder at designe DNA oligo prober, der skal bruges i analysen. Oligoerne er den dynamiske del af analysen, og oligoerne er designet til specifikt at detektere målgenerne af interesse. Jeg har arbejdet med bDNA-teknologien i 15 år.

spørgsmål: fortæl mig om din professionelle rejse. Har du altid støttet Kvantitigenassays? Jeg ved, at Affymetrics og Panomics var ophavsmændene til dette produkt.

AP: Dette var mit første job uden for college. Jeg blev ansat af Genospectra i Fremont, Californien, den by, hvor jeg voksede op. Genospectra fusionerede med Panomics, som derefter fusionerede med Affymetriks, som derefter købte eBioscience … og så blev vi erhvervet af Thermo Fisher Scientific. Næsten 15 år senere, her er jeg, stadig i bioinformatik tjenester.

spørgsmål: Hvad kan du bedst lide ved din nuværende rolle?

AP: hver dag er en anden dag. Der er meget variation i min rolle, som holder tingene friske. Jeg kommer også til at arbejde direkte med kunder, så jeg får høre og se en masse banebrydende ideer i vores branche.

spørgsmål: Hvad er et initiativ eller projekt, du er særlig stolt af?

AP: det er svært at indsnævre det til kun en! Monsanto brugte vores assay under deres test af et dobbeltstrenget RNA, der introduceres i majs for at hjælpe med at redde honningbier.

spørgsmål: Hvad er noget, de fleste mennesker ikke ved om et Kvantitetsprodukt, instrument eller service?

AP: Den sande skønhed ved analysen er, at der ikke er behov for at rense mål-RNA eller DNA, og det fungerer med klassisk vanskelige prøver, såsom FFPE-vævsprøver. Derudover er det en meget robust og meget præcis analyse. Vi har også løsninger til screening med høj kapacitet, og Kvantitigen er den ideelle løsning til sekundær screening for forbindelser, der er målrettet mod gener.

spørgsmål: Hvilken nuværende forskning eller kliniske tendenser i branchen er du begejstret for?

AP: Hepatitis B studeres intenst i disse dage, og vi har skabt løsninger til forskningsverdenen for bedre at forstå, hvordan man behandler—eller endda forhåbentlig en dag helbreder—en patient med denne virus, som er epidemi i mange dele af verden.

spørgsmål: hvis du kunne løse enhver videnskabelig udfordring eller menneskers sundhedskrise, hvad ville det være?

AP: for menneskers sundhed vil jeg sige bedre terapier til diabetikere. Jeg blev født her i USA, men min etnicitet er indisk, og der er mange medlemmer af vores samfund og min familie, der kæmper med denne sygdom såvel som andre metaboliske syndromer.

spørgsmål: Hvad er din yndlings ting at gøre uden for arbejdet?

AP: som far til to små småbørn er fritid svært at komme forbi. Når jeg kan, nyder jeg bare at sætte mine fødder op og slappe af lidt og se fodbold eller deltage i spil.

6 tip til Kvantitigenassays

arbejde med Kvantitigenpleksassays? Patel tilbød disse tip til brugere:

  1. kunden vil have en direkte linje til bioinformatikteamet for at arbejde på panellisten og specielle designanmodninger. Vi håndterer alle oligo designs. Det er en fuld service.
  2. det hjælper med at bruge flere reference – / husholdningsgener i dit panel til mere robust datanormalisering, hvis en af dem påvirkes af en behandling eller tilstand.
  3. du skal ikke bekymre dig om at rense noget RNA. Kvantitigenassays fungerer direkte fra lysater eller homogenater og fungerer især godt med vanskelige prøver, såsom FFPE-vævssektioner.
  4. sørg for, at du har det rigtige udstyr: Lumineksinstrument, hybridiseringsovn, magnetpladeskive osv.
  5. vær forberedt på alle data. Du kan måle op til 80 gener samtidigt, så der er masser af indsigt, der skal opnås.
  6. hvis du ikke ved, hvilke mål du vil medtage i dit brugerdefinerede panel, har vi et sti-søgeværktøj i vores online panelkonfigurator, der kan hjælpe dig. Alternativt kan du starte med et af vores foruddesignede paneler, der er sammensat af omhyggeligt kuraterede genmål, der er specifikke for en bestemt sygdom, vej eller forskningsområde.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.