Conception et construction de lignées consanguines recombinantes

Résumé

Les lignées consanguines recombinantes (RIL) sont une collection de souches qui peuvent être utilisées pour cartographier des locus de caractères quantitatifs. Les souches parentes sont croisées pour créer des recombinants qui sont ensuite consanguins à l’isogénicité, ce qui donne une ressource permanente pour la cartographie et l’analyse des traits. Je décris ici le processus de conception et de construction des RIL. Cela comprend les étapes suivantes. Les souches parentales sont sélectionnées en fonction du phénotype, de la disponibilité des marqueurs et de la compatibilité, et elles peuvent être génétiquement modifiées pour éliminer les variations indésirables ou pour introduire des reporters. Un schéma de conception de la construction est déterminé, y compris la taille de la population cible, si et comment un croisement avancé sera effectué, et le nombre de générations de consanguinité. Des croisements parents et des croisements F1 sont effectués pour créer une population F2. Selon la conception, des croisements avancés peuvent être mis en œuvre pour augmenter la résolution de la cartographie grâce à l’accumulation d’événements de croisement méiotiques supplémentaires. Enfin, les lignées sont consanguines pour créer des lignées recombinantes génétiquement stables. Je discute des conseils et des techniques pour maximiser la puissance et la résolution de la cartographie et minimiser l’investissement en ressources pour chaque étape du processus.

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