Tunnistusjakso

tunnistusjakso on DNA-sekvenssi, johon DNA: ta sitovan domeenin rakenteellisella motiivilla on sitova spesifisyys. Tunnistussekvenssit ovat palindromeja.

transkriptiotekijä Sp1 esimerkiksi sitoo sekvenssit 5′-(G/T)GGGCGG(G/A)(G/A)(C/T)-3′, jossa (G/T) osoittaa domeenin sitovan guaniinin tai tymiinin tässä asennossa.

restrikti-endonukleaasi pesti tunnistaa, sitoo ja katkaisee sekvenssin 5′-CTGCAG-3′.

tunnustamisjärjestys on erilainen kuin tunnustamispaikka. Tietty tunnistussekvenssi voi tapahtua yhden tai useamman kerran tai ei ollenkaan tietyllä DNA-fragmentilla. Tunnistuspaikka määritellään paikan sijainnin mukaan. Esimerkiksi seuraavassa DNA-sekvenssin fragmentissa on kaksi PstI-tunnistuspaikkaa, jotka alkavat vastaavasti tyvestä 9 ja 31. Tunnistusjakso on tietty sekvenssi, joka on yleensä hyvin lyhyt (alle 10 emästä). Proteiinin spesifisyyden asteesta riippuen DNA: ta sitova proteiini voi sitoutua useampaan kuin yhteen tiettyyn sekvenssiin. Psti: lle, jolla on yksi sekvenssispesifisyys, se on 5′-CTGCAG-3′. Se on aina sama, onko ensimmäinen tunnustamispaikka vai toinen seuraavassa esimerkissä järjestyksessä. SP1: lle, jolla on useita (16) sekvenssispesifisyyttä, kuten edellä on esitetty, kaksi tunnistuskohtaa seuraavassa esimerkissä sekvenssifragmentti ovat 18 ja 32, ja niiden vastaavat tunnistusjaksot ovat 5′-GGGGCGGAGC-3′ ja 5′-TGGCGGAAC-3′.

5′-AACGTTAGGCTGGCAGGAATTGGAACCT-3′

Vastaa

Sähköpostiosoitettasi ei julkaista.