Diseño y Construcción de Líneas Endogámicas Recombinantes

Resumen

Las líneas endogámicas recombinantes (RILs) son una colección de cepas que se pueden usar para mapear loci de rasgos cuantitativos. Las cepas parentales se cruzan para crear recombinantes que luego son endogámicas a la isogenicidad, lo que resulta en un recurso permanente para el mapeo y análisis de rasgos. Aquí describo el proceso de diseño y construcción de RILs. Consta de los siguientes pasos. Las cepas parentales se seleccionan en función del fenotipo, la disponibilidad de marcadores y la compatibilidad, y pueden ser modificadas genéticamente para eliminar variaciones no deseadas o para introducir reporteros. Se determina un esquema de diseño de construcción, que incluye el tamaño de la población objetivo, si se realizará el cruzamiento avanzado y cómo, y el número de generaciones de endogamia. Los cruces de padres y los cruces de F1 se realizan para crear una población de F2. Dependiendo del diseño, se puede implementar un cruce avanzado para aumentar la resolución del mapeo mediante la acumulación de eventos de cruce meiótico adicionales. Finalmente, las líneas son endogámicas para crear líneas recombinantes genéticamente estables. Discuto consejos y técnicas para maximizar la potencia y resolución de mapeo y minimizar la inversión de recursos para cada etapa del proceso.

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