Design og konstruktion af rekombinante indavlede linjer

abstrakt

rekombinante indavlede linjer (RILs) er en samling af stammer, der kan bruges til at kortlægge kvantitative træk loci. Forældrestammer krydses for at skabe rekombinanter, der derefter indavles til isogenicitet, hvilket resulterer i en permanent ressource til egenskabskortlægning og analyse. Her beskriver jeg processen med at designe og konstruere RILs. Dette består af følgende trin. Forældrestammer vælges ud fra fænotype, markørtilgængelighed og kompatibilitet, og de kan være genetisk manipuleret til at fjerne uønsket variation eller introducere journalister. En konstruktion design ordning bestemmes, herunder målpopulationen størrelse, hvis og hvordan avanceret intercrossing vil blive gjort, og antallet af generationer af indavl. Forældrekryds og F1-kryds udføres for at skabe en F2-befolkning. Afhængigt af design kan Avanceret intercrossing implementeres for at øge kortlægningsopløsningen gennem akkumulering af yderligere meiotiske crossover-begivenheder. Endelig indavles linjer for at skabe genetisk stabile rekombinante linjer. Jeg diskuterer tip og teknikker til at maksimere kortlægningskraft og opløsning og minimere ressourceinvesteringer for hvert trin i processen.

Skriv et svar

Din e-mailadresse vil ikke blive publiceret.