Seznamte Ankit Patel, QuantiGene™ test Developer na Thermo Fisher Scientific

Plus: 6 tipů pro QuantiGene testy

pokud chcete test, který dokáže detekovat nukleové kyseliny, pravděpodobně si vyberete vysoce kvalitní testy Invitrogen™ ProcartaPlex™ a QuantiGene™ Plex od Thermo Fisher Scientific, partnera Luminex. Test Kvantigenu používá technologii rozvětvené DNA (bDNA), která se spoléhá na zesílení signálu namísto cílového zesílení pro optimální kvantifikaci transkriptů. Jedním z vědců, kteří stojí za návrhem a vývojem testu QuantiGene, je Ankit Patel, vědec v bioinformatických službách společnosti Thermo Fisher. Dohnali jsme ho, abychom se dozvěděli více o jeho práci a testech, které vyvíjí.

otázka: co děláte v Thermo Fisher?

Ankit Patel: svou primární roli bych popsal jako bioinformatické služby, kde spolupracujeme přímo s distributory, prodejem, marketingem a/nebo zákazníky, abychom pomohli navrhnout nové testy. Klienti nás osloví se svými projekty, a pracujeme s nimi na vývoji nejlepšího možného testu pro zodpovězení jejich experimentálních otázek, včetně návrhu dna oligo sond, které budou použity v testu. Oligos jsou dynamickou částí testu a oligos jsou navrženy tak, aby specificky detekovaly cílové geny, které jsou předmětem zájmu. S technologií bDNA pracuji již 15 let.

otázka: řekněte mi o své profesionální cestě. Podporovali jste vždy testy QuantiGene? Vím, že Affymetrix a Panomics byly původci tohoto produktu.

AP: Tohle byla moje první práce na vysoké škole. Byl jsem najat Genospectrou ve Fremontu, Kalifornie, město, kde jsem vyrostl. Genospectra se sloučila s Panomikou, která se poté sloučila s Affymetrixem, který pak koupil eBioscience … a pak nás získal Thermo Fisher Scientific. Téměř 15 let později, tady jsem, stále v bioinformatických službách.

otázka: co se vám na vaší současné roli nejvíce líbí?

AP: každý den je jiný den. V mé roli je spousta rozmanitosti, což udržuje věci čerstvé. Také pracuji přímo se zákazníky, takže v našem oboru slyším a vidím spoustu špičkových nápadů.

otázka: na jakou iniciativu nebo projekt jste obzvláště hrdí?

AP: je těžké to zúžit jen na jednu! Monsanto použil náš test při testování dvouvláknové RNA, která se zavádí do kukuřice, aby pomohla zachránit včely medonosné.

otázka: Co je něco, co většina lidí neví o Kvantigenovém produktu, nástroji nebo službě?

AP: Skutečná krása testu spočívá v tom, že není třeba čistit cílovou RNA nebo DNA a pracuje s klasicky obtížnými vzorky, jako jsou vzorky tkáně FFPE. Navíc je to velmi robustní a vysoce přesný test. Máme také řešení pro vysoce výkonný screening a Quantigen je ideálním řešením pro sekundární screening sloučenin, které cílí na geny.

otázka: Jaký současný výzkum nebo klinické trendy v oboru jste nadšeni?

AP: Hepatitida B je v těchto dnech intenzivně studována a vytvořili jsme řešení pro výzkumný svět, abychom lépe porozuměli tomu, jak léčit—nebo dokonce, doufejme, jednoho dne vyléčit-pacienta s tímto virem, který je epidemický v mnoha částech světa.

otázka: Pokud byste mohli vyřešit jakoukoli vědeckou výzvu nebo krizi lidského zdraví, co by to bylo?

AP: pro lidské zdraví bych řekl lepší terapie pro diabetiky. Narodil jsem se zde v USA, ale moje etnická příslušnost je indická, a existuje mnoho členů naší komunity a mé rodiny, kteří bojují s touto nemocí a dalšími metabolickými syndromy.

otázka: Jaká je vaše oblíbená věc mimo práci?

AP: jako otec dvou malých batolat je těžké získat volný čas. Kdykoli můžu, jen si užívám vstávání nohou a trochu si odpočinu, a sledovat fotbal nebo navštěvovat hry.

6 tipů pro Kvantigenové testy

práce s kvantigenovými Plex testy? Patel nabídl tyto tipy pro uživatele:

  1. zákazník bude mít přímou linku do bioinformatického týmu, který bude pracovat na seznamu panelů a speciálních požadavcích na design. Řešíme všechny návrhy oligo. Je to kompletní servis.
  2. pomáhá používat více referenčních / úklidových genů ve vašem panelu pro robustnější normalizaci dat v případě, že jeden z nich je ovlivněn léčbou nebo stavem.
  3. nedělejte si starosti s čištěním jakékoli RNA. Kvantigenové testy pracují přímo z lyzátů nebo homogenátů a pracují zvláště dobře s obtížnými vzorky, jako jsou tkáňové řezy FFPE.
  4. ujistěte se, že máte správné vybavení: přístroj Luminex, hybridizační pec, magnetická podložka atd.
  5. buďte připraveni na všechna data. Můžete měřit až 80 genů současně, takže je třeba získat spoustu poznatků.
  6. pokud nevíte, které cíle chcete zahrnout do svého vlastního panelu, máme v našem online konfigurátoru panelů nástroj pro vyhledávání cest, který vám pomůže. Alternativně můžete začít s jedním z našich předdefinovaných panelů, které se skládají z pečlivě upravených genových cílů specifických pro konkrétní nemoc, cestu nebo oblast výzkumu.

Napsat komentář

Vaše e-mailová adresa nebude zveřejněna.